شبکه پزشکی مولکولی کشور با همکاری پژوهشکده علوم غدد درون ریز و متابولیسم دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی کارگاه 2 روزه ای تحت عنوان : " معرفی و آموزش پایگاه اطلاعاتی UCSC Genome Bioinformatics Site " را در تاریخ 14 و 15 آبان ماه 1392 برگزار می نماید.
مقدمه و تعریف:
بر اساس چشم انداز سند نقشه جامع علمی کشور تا سال 1404 تعداد مراکز دانشگاهی و در کنار آن پژوهشگاه ها، پژوهشکده ها و مراکز تحقیقاتی رو به افزایش می باشد.
با افزایش این مراکز و همچنین با حضور نیرو های متخصص در زمینه های مرتبط میزان داده ها نیز افزایش می یابد.
در زمینه تحقیقات بیولوژیک داده های بانک های اطلاعاتی اینترنتی بصورت روزانه در حال تغییر و ارتقاء هستند. آشنایی با نحوه کار این پایگاه های اطلاعاتی لازمه پژوهشگر از ابتدای طراحی پروژه تا انتهای آن می باشد. با پایان یافت پروژه ژنوم انسان در سال 2003 پایگاه های اینترنتی متفاوتی جهت ارائه اطلاعات ژنومی به محققین در سطح دنیا تشکیل گردید. بانی مالی و علمی این پایگاه های داده مراکز دولتی و دانشگاهی در کشور های پیشرفته می باشند. یکی از این مراکز دانشگاه سانتا کروز در ایالت کالیفرنیا امریکا می باشد که بانی سایت ژنوم به نام (UCSC Genome Browser (UCSC می باشد. این سایت اولین بار در سال 2000 ارائه شد و اطلاعات مربوط به ژنوم موجودات مهره دار و بی مهرگان را در دسترس قرار داده است. آشنایی با نحوه کار این بانک داده برای دانشجویان و محققان رشته های مرتبط با علوم بیولوژیک ضروری به نظر می رسد.
موارد کاربرد کارگاه:
آشنایی با این پایگاه اطلاعاتی به پیشرفت و ارتقاء علمی دانشجویان و محققین کمک می نماید. نتیجه این آشنایی می تواند منجر به نتایج علمی بهتر و ارتقاء سطح تحقیقات آنها شود.
سرفصل های کارگاه:
در این کارگاه قابلیت های مختلف UCSC به شرح زیر آموزش داده خواهند شد:
1- آشنایی با صفحه اول این بانک داده و معرفی هر کدام از لینک های آن
2- آشنایی با جستجوی اولیه در UCSC
3- شناخت هر کدام از track ها
4- نحوه گرفتن جزئیات توالی ژنی
5- آشنایی با مفهوم و نحوه BLAT
6- آشنایی با PCR الکترونیکی
مراحل ثبت نام و انتخاب شرکت کنندگان:
افراد مجاز به شرکت در این کارگاه عبارتند از :
1- متخصصین ژنتیک پزشکی (PhD ژنتیک).
2- کارشناسان ارشد ژنتیک پزشکی.
3- دانشجویان PhD ژنتیک و دانشجویان ارشد PhD ژنتیک.
4- دانشجویان و یا فارغ التحصیلان رشته های بیوشیمی، بیو انفورماتیک بیوتکنولوژی و کلیه رشته های مرتبط با بیولوژی.
5- کارشناسان علوم آزمایشگاهی و پزشکان عمومی و مشاوران ژنتیک.
با در نظر گرفتن شرایط کارگاه از نظر تعداد افراد، به تعداد مورد نظر ( 20 نفر) از میان افراد فوق انتخاب شده و ثبت نام نهایی انجام خواهد شد.
تلفن ثبت نام:
66954324_021
برنامه روز اول کارگاه:
8:30-9:00 .............ثبت نام اولیه
9:00-9:45.............معرفی بانک داده UCSC توسط خانم دکتر دانشپور
9:45-10:30............آشنایی با جستجوی اولیه در UCSC توسط خانم دکتر دانشپور
10:30-11:00..........استراحت و پذیرایی
11:00-12:15...........شناخت هر کدام از track ها توسط آقای دکتر فلاح
12:15-13:00............تمرین عملی توسط خانم صداقتی
13:00-14:00 ............نماز و نهار
14:00-16:00 .............تمرین عملی توسط آقای دکتر فلاح
برنامه روز دوم کارگاه:
9:00-9:45 .............نحوه گرفتن جزئیات توالی ژنی توسط آقای دکتر فلاح
9:45-10:30.............تمرین عملی توسط خانم صداقتی
10:30-11:00...........استراحت و پذیرایی
11:00-11:30............آشنایی با مفهوم و نحوه BLAT توسط آقای دکتر فلاح
11:30-12:30............تمرین عملی توسط خانم صداقتی
12:30-13:00 ............جستجوی پیشرفته توسط خانم دکتر دانشپور
13:00-14:00 ............نماز و نهار
14:00-15:00 .............مروری بر کارگاه و بحث و گفتگو توسط گروه
لازم به ذکر است:
کارگاه فوق دارای تائیدیه از اداره کل آموزش مداوم وزارت بهداشت بوده و در پایان دوره به افراد شرکت کننده در کارگاه گواهی معتبر و قابل ترجمه توسط شبکه پزشکی مولکولی کشور ارائه می گردد.