کارگاه بیوانفورماتیک و طراحی پرایمر
در تاریخ سه شنبه، ۰۸ بهمن ۱۳۹۲ توسط ahmadvand

اخبار علمی مجتمع تولیدی و تحقیقاتی انستیتو پاستور ایران کارگاه 2 روزه بیوانفورماتیک و طراحی پرایمر را
در تاریخ 8 و 7 اسفند ماه 92 برگزار می نماید.

الف. مقدمه و تعریف کارگاه:
بیوانفورماتیک دانشی نوین و تلفیقح از علوم زیستی و کامپیوتر است. در حقیقت پیشرفته های علمی بشر در زمینه زیست شناسی و ظهور فناوریهای جدید در زمینه ذخیره، پردازش و بازیافت داده ها سرنوشت این علوم را به هم گره زد تا در مدت کوتاه حجم اطلاعات علمی زیست شناسی و ارزش آنها چند برابر گردد. همانند همه علوم نوین بیوانفورماتیک نیز در سالهای اخیر بتدریج در فهرست دروس رشته های مختلف دانشگاهی و منابع امتحانی وارد شده است.
یادگیری این علم کمک می کند افراد بتوانند خودشان از مزایا، امکانات و ابزارهای رایگان شبکه ایی فراوان موجود در این زمینه، بهره گیرند. برای استفاده از این زمینه علمی جدید لازم نیست همه دانشهای مرتبط با آنرا بیاموزیم هر چند یادگیری دانش و فن آوری مورد نیاز برای تولید آن برای کاربران عادی پیچیده است. در دنیای امروزی زیست شناسان همانند سایر مشاغل بسیار تخصصی از کامپیوترها استفاده می کنند بسیاری از وظایفی که توسط چنین مشاغلی انجام می شود برای اغلب ما معمولی هستند. اما این اعمال پیچیده همراه با رشته بیوانفورماتیک را ایجاد می کنند بطور اختصاصی تر بیوانفورماتیک را می توان بصورت شاخه محاسباتی زیست شناسی مولکولی تعریف کرد. قبل از عصر بیوانفورماتیک فقط دو راه حل برای انجام آزمایشهای زیست شناسی وجود داشت درون یک موجود زنده (in vivo) و در یک محیط مصنوعی (in vitro) با گسترش این اصطلاحات می توانیم بیوانفورماتیک را زیست شناسی Insilco بنامیم که از نام تراشه های سلیکونی تشکیل دهنده ریزپردازنده ها گرفته شده است. مطمئناَ این روش جدید انجام مطالعه زیست شناسی بسیار رایج شده است اما رایج شدن به معنای آسانتر یا راحت تر و سریعتر شدن نیست. بیوانفورماتیک به مرحله ایی فراتر از رایج شدن رسیده است و در قلب اغلب پیشرفته های اخیر زیست شناسی همانند رمزگشای ژنوم انسان، زیست شناسی سامانه ایی (سیستم بیولوژی) فناوریهای زیستی جدید، روشهای پزشکی قانونی و جنایی جدید و همچنین پزشکی مختص بفرد(Personalize medicine) در آینده قرار دارد. به علت مرکزی بودن بیوانفورماتیک نسبت به پیشرفت های اخیر زیست شناسی مولکولی افراد با زمینه های علمی مختلف تعریف های متفاوتی برای این اصطلاح ارائه می دهند.

هدف از این کارگاه آموزش و انتقال دانش بیوانفورماتیک در شاخه ژنومیک به دانشجویان و متخصصین می باشد. در این کارگاه افراد با انواع بانکهای اطلاعاتی ژنومیک، روشهای جستجو در این بانکها، گرفتن انواع توالی ژنوم و تفسیر دادها، آشنایی با طراحی پرایمر، آشنایی با نرم افزار های طراحی پرایمر و استفاده از نرم افزار BLAST آشنا خواهند شد.

در پایان این کارگاه افراد شرکت کننده مهارتهای زیر را کسب می کنند:

1- آشنایی و استفاده از بانکهای ژنومی
2- روشهای جستجو در این بانکها
3- گرفتن توالی از بانکهای ژنومی
4- معرفی کامل بانک NCBI
5- تفسیر داده ها
6- آموزش طراحی پرایمر
7- آشنایی با نرم افزارهای طراحی پرایمر
8- آشنایی با نرم افزار BLAST

ب. سرفصلهای کارگاه:

_ مباحث تئوری:

اهمیت بیوانفورماتیک
آشنایی با بانکهای اطلاعاتی ژنومی
آشنایی با نرم افزارBLAST
مراحل طراحی پرایمر
خصوصیات پرایمر بهینه
گرفتن توالی از بانکهای اطلاعاتی
طراحی پرایمر با نرم افزار

_ مباحث عملی:

گرفتن توالی از بانکهای اطلاعاتی ژنومی مختلف
طراحی پرایمر با دو نرم افزار (Oligo 6, Generuner)
نرم افزار BLAST

روز اول
معرفی بیوانفورماتیک و پایگاههای اطلاعاتی ژنومی (دکتر پریان) 10:30-9
پذیرایی 10:45-10:30
NCBI و کار عملی (دکتر راز) 12:45-10:45
نهار و نماز 13:45-12:45
معرفی پایگاههای اطلاعاتی پروتئینی (دکتر محمدی یگانه) 15:30-13:45
پذیرایی 15:45-15:30
آشنایی با نرم افزارهای همتایابی توالی ها Mega5 (دکتر آقایی) 17-15:45
روز دوم
خصوصیات پرایمر ایده آل (دکتر پریان) 10:30-9
پذیرایی 10:45-10:30
آشنایی با نرم افزار طراحی پرایمر Oligo7 (دکتر راز) 12:30-10:45
نهار و نماز 13:30-12:30
آشنایی با نرم افزارهای طراحی پرایمرOn-line (دکتر پریان) 14:30-13:30
BLAST اصول تئوری و انجام کار عملی (دکتر محمدی یگانه) 15:30-14:30
پذیرایی 15:45-15:30
حل تمرین و رفع اشکال 16:15-15:45
آشنایی با پروتئین ها ( گرفتن توالی، گرفتن ناحیه خاص پروتئین، به دست آوردن موتیف ها، برهمکنش پروتئین ها)
آشنایی با چند سایت سودمند PCR in silico, Gene Cards, KEGG,… (دکتر آقایی) 17:30-16:15




برگزار کننده و محل برگزاری: مجتمع تولیدی و تحقیقاتی انستیتو پاستور کرج

_ دارای امتیاز باز آموزی از وزارت بهداشت

_ دارای گواهی معتبر از انستیتو پاستور ایران

_ توجه: دارای سرویس ایاب و ذهاب( جهت تسهیل در رفت و آمد شرکت کنندگان، سرویس ایاب و ذهاب از درب انستیتو پاستور تهران مهیا می باشد).

_ تاریخ برگزاری:8 -7 اسفندماه 92

_ هزینه شرکت در دوره برای هر نفر:
دانشجویی و اعضای انجمنهای علمی کشور 120/000 هزار تومان
و آزاد 140/000 هزار تومان

_ تلفن تماس : 66954324-021




کارگاه بیوانفورماتیک و طراحی پرایمر | ورود/ایجاد حساب کاربری | 0 نظر ارسال شده است
ما در قبال نظرات پاسخگو نیستیم.

معرفی شبکه

صفحه نخست

درباره شبکه
اهداف
رسالت (ماموریت)
اولویت ها

برنامه استراتژیک
اساسنامه (جدید)
اعضا شبکه
آمار

آخرین اخبار
· کارگاه مهندسی ژنتیک اول و دوم آذر 1401 (دوشنبه، ۲۳ آبان ۱۴۰۱)
· نهمین دوره آنلاین برنامه کشوری " تربیت زیست پژوهشگر" (شنبه، ۱۸ دی ۱۴۰۰)
· از ژن تا درمان (2) (سه شنبه، ۰۵ مرداد ۱۴۰۰)
· هشتمین دوره آنلاین برنامه کشوری " تربیت زیست پژوهشگر" (شنبه، ۲۸ فروردین ۱۴۰۰)
· آشنایی با روشهای سلولی مولکولی، تولید داروهای بیولوژیک و کاربرد آنها در درمان ( از ژن تا درمان) (سه شنبه، ۳۰ دی ۱۳۹۹)
مجمع عمومی
دستورالعمل برگزاری مجمع عمومی
ارکان شبکه

شبکه پزشکی مولکولی کشور زیر نظر معاونت تحقیقات و فناوری بوده و ارکان آن شامل ساختار ذیل است:

اعضاء شبکه

شورای راهبردی 

رئیس شبکه 

دبیرخانه  

شورای پژوهشی- آموزشی

فعالیت های شبکه

 زیرساختاری
 ستادی و اجرایی
 آموزشی

ابزار و امکانات سایت
· مدیریت سایت
· ثبت نام و ایجاد کاربر جدید
· فرم ها و گزارش ها
· سوالات پرسیده شده
· فهرست کاربران
· اخبار
· معرفی ما به دوستانتان
· انتقادات و پیشنهادها
· جستجو پیشرفته
· گزارش ها و مقالات علمی
· آمار مشاهدات
· ارسال خبر
· عناوین
· لیست برگزیده
· پیوندها
· خروج
پذیرش طرح

شرایط پذیرش طرح

اهداف پذیرش طرح

اولویت های تحقیقاتی
گردش کار بررسی طرح

شاخص های انتخاب طرح

پرسشنامه طرح های تحقیقاتی 
راهنمای نگارش طرح

ارتباط با شبکه

دبیرخانه شبکه پزشکی مولکولی ایران از سال 1379 و بنابر صلاح دید معاونت تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت ، درمان و آموزش پزشکی در انستیتو پاستور ایران مستقر می باشد.
کلیه علاقمندان می توانند برای کسب اطلاعات بیشتر با شماره واتساپ دبیرخانه شبکه 09373022275 یا به آدرس پست الکترونیکی شبکه molmednet@gmail.com تماس حاصل نمایند.



Copyright© 2008-2023 Iranian Molecular Medicine Network
Webmaster: Dr. Kasra Esfahani